1) Was hat die Gerudokriegerin zu bedeuten, die am Fluss steht(mit Kuh) die einen sagt, man sei schon wieder da? (kleiner Link)
Als kleiner Link gibts bei den Gerudos nichts besonderes. Sie bewachen einfach den Zugang zur ihrer Festung. Übrigens, die Kuh kannst du melken (Eponas Lied).

2) Wo kann man als kleiner Link im Todeskrater die Wunderbohne pflanzen?
In der Nähe der Plattform vor dem Feuertempel, wo du ankommst, wenn du den Bolero des Feuers spielst.

3) Im Feuertempel, in dem 1. Raum in dem viele Kugeln rollen, hört man immer eine Skulltulla, ich finde sie nie -.-
Taste die Wand mit dem Schwert ab. Es gibt eine Stelle die etwas hohl klingt. Sprenge mit einer Bombe oder falls du den Hammer hast, nimm den.

Streif während dem Reiten die Mauer oder den Felsen. Ich glaube nicht, dass er ganz verschwunden ist.

das ist teilweise auch tageszeitenabhängig, möchte ich sagen. bzw denke ich...

nein weiter unten sind Büsche, also solche Grasdinger, reite durch einen bestimmten durch, da müsste er auftauchen.

Hach ja, wie lange habe ich damals auf dem Wiesenhügel vor dem Schloss gestanden, den Dekustab in die Luft gereckt und gewartet, dass die Schmetterlinge endlich etwas tun

Das bekommt man von irgendeinem Quasselstein erzählt, aber soweit ich weiß, erzählen nicht alle etwas Nützliches. Ich glaube, dieser Mythenstein gehört dazu

Mir ist das schon mal gelungen...
Gehört Geduld und vor allem Glück dazu